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上海士鋒生物科技有限公司
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士鋒光譜法研究苯甲酸鈉與DNA的體外作用

時間:2015-12-16閱讀:592
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1.前言
測定小分子與核酸相互作用的親和力及鍵合選擇性,有利于闡明小分子與核酸的選擇鍵和作用以及理解其鍵合機理,有利于進一步探討小分子的結(jié)構(gòu)與核酸作用模式及其生物活性之間的關(guān)系。實驗發(fā)現(xiàn),有一些小分子與核酸只有弱作用力,但對核酸產(chǎn)生一定作用,進而對復(fù)制、遺傳和代謝產(chǎn)生一定的影響,涉及到這一領(lǐng)域的研究還很少[1].
紫外-可見分光光度法和熒光光譜法是研究小分子與核酸相互作用機理的zui常用、zui方便的方法。許多小分子與核酸結(jié)合后,核酸或小分子的吸收光譜或發(fā)射光譜會發(fā)生變化。對光譜的這些變化進行分析處理,可獲得大分子的構(gòu)象的變化情況,甚至可獲得一些熱力學(xué)數(shù)據(jù)[2]。
苯甲酸鈉是常用的食品添加劑,在世界各國均被廣泛使用,尤其在我國。現(xiàn)在普遍認為苯甲酸無毒,但由于苯甲酸鈉使用的廣泛性,它涉及每個人的生命,對它的方方面面不斷進行研究是很有必要的。另外,苯甲酸鈉也作為藥物大劑量使用,用來治療氮代謝異常。因此對苯甲酸鈉的毒性研究,特別是和生物大分子作用的研究仍是非常重要的。
本文利用紫外-可見分光光度法及熒光光譜法,對體外苯甲酸鈉與DNA的相互作用進行了研究。
2.實驗部分
2.1 儀器與試劑
儀器:日本島津RF-540熒光光度計,美國Cary-1E紫外-可見分光光度計, 日本島津UV-240紫外-可見分光光度計,CS501型超級恒溫槽(重慶試驗設(shè)備廠)。
試劑:小牛胸腺DNA(>99%,北京百泰生化技術(shù)公司),苯甲酸鈉(PhCOONa,分析純),其余試劑是分析純或分析純以上品質(zhì)。TEN緩沖溶液(10 mM Tris-HCl / 1 mM EDTA / 2 mM NaCl, pH=7.4),磷酸鹽緩沖溶液(KH2PO4 / Na2HPO4, pH=7.4).
2. 2 熒光光譜法測定PhCOONa對DNA構(gòu)象的影響
保持DNA濃度恒定(10 μg/mL),改變PhCOONa濃度,在TEN緩沖溶液中配制一系列樣品(pH=7.4),在37 ℃溫浴1小時。自然冷卻至室溫后,分別加入熒光探劑溴化乙錠(EB)至終濃度為20 μg/mL。放置30 min后用日本島津RF-540熒光分光光度計進行測量。測定條件為:激發(fā)波長360.0 nm;激發(fā)狹縫5nm;發(fā)射狹縫5 nm;DNA-EB發(fā)射峰位在589 nm。
2.3 熒光光譜法測定DNA對PhCOONa的影響
保持PhCOONa濃度恒定(2.77 mg/mL),改變DNA濃度,在PBS緩沖溶液中配制一系列樣品(pH=7.4),在37 ℃溫浴1小時。自然冷卻至室溫后,用日本島津RF-540熒光分光光度計進行測量。測定條件為:激發(fā)波長282.0 nm;激發(fā)狹縫5 nm;發(fā)射狹縫5 nm。
2.4 紫外可見分光光度法測定PhCOONa對DNA的影響
保持DNA濃度恒定(70.0 μg/mL),改變PhCOONa濃度,在PBS緩沖溶液中配制一系列樣品(pH=7.4),以相應(yīng)的不含DNA的溶液做參比。 所有樣品和參比于37 ℃溫浴1小時后,自然冷卻至室溫,采用5 mm樣品池, 用日本島津UV-240紫外可見分光光度計進行測量。

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