由于免疫組化具有特異性強、靈敏度高、定位準確等特點，且能將形態研究與功能研究有機地結合在一起，所以，這門新技術已被廣泛地應用于生物學和醫學研究的許多領域。在病理學研究中，免疫組化技術的作用和意義更為重要。以腫瘤研究為例，在免疫組化技術出現以前，對腫瘤的診斷和分類還局限于細胞水平，而引入免疫組化技術后，則使研究的深度提高到了生物化學水平、分子水平。近年來，伴隨基因探針研究而興起的核酸分子原位雜交技術也正在蓬勃發展，更使免疫組化如虎添翼，兩者相得益彰，將研究推進到了基因水平。elisa試劑盒
1、確定細胞類型
通過特定抗體標記出細胞內相應抗原成分，以確定細胞類型。如角蛋白是上皮性標記，前列腺特異性抗原僅見于前列腺上皮，甲狀腺球蛋白抗體是甲狀腺濾泡型癌的敏感標記，而降鈣素抗體是甲狀腺髓樣癌的*標記。有些細胞（如表皮內朗格漢斯細胞、黑色素細胞、淋巴結內指突狀和樹突狀網織細胞）光鏡下不易辨認，但免疫組化標記（S-100蛋白等）能清楚顯示其形態。
2、辨認細胞產物
利用某些細胞產物為抗原制備的抗體，可作為相應產物的特殊標記，如內分泌細胞產生的各種激素，大多數可用免疫組化技術標記出來，據此可對內分泌腫瘤作功能分類，檢測分泌異位激素的腫瘤等。
3、了解分化程度
大多數標記物都有其特定的分布部位，如上皮細胞膜抗原（EMA）著色部位在細胞膜上，但差分化乳癌胞漿內也可出現陽性顆粒；角蛋白的含量也與分化程度有關，低分化或未分化癌含量較低、染色較弱。
4、鑒定病變性質
通過標記Ig輕鏈（κ、λ）可區分部分B細胞性淋巴瘤與B細胞反應性增生，前者常表達單一的Ig輕鏈（κ+/λ+），后者常為多克隆Ig輕鏈（κ+、λ+）。而標記Bcl-2蛋白在區別濾泡型淋巴瘤和反應性濾泡增生上有相當的意義。在濾泡型淋巴瘤，90%以上腫瘤性濾泡細胞有bcl-2的高表達；而在濾泡反應性增生時，濾泡反應中心的細胞不表達Bcl-2蛋白，而套細胞則表達。 elisa試劑盒
