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上海古朵生物科技有限公司

不同處理組織的方法對提取RNA產(chǎn)量的影響

時間:2018-9-27閱讀:827
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實驗方法原理 :   

RNA 提取過程中應(yīng)注意的是:組織或細(xì)胞在變性液中*裂解的同時,如何抑 RNase 引起的 RNA 降解問題。在直接加工新鮮組織時,所有的細(xì)胞能盡可能快的接觸變性劑以*裂解這一步是相當(dāng)重要的。一些難以加工的組織,例如:堅硬的腫瘤、細(xì)菌細(xì)胞、植物根部等,即使使用勻漿器一般也不能很有效的裂解。此時,通常可以在處理組織時,先對其進(jìn)行冷凍處理,以使之充分裂解。

 

為使迅速冷凍樣品,以使整塊組織*冷凍,因此,在冷凍前應(yīng)先將組織切成小塊,然后將其浸沒于液氮中。這將會使組織塊以快的方式冷凍。另外,也可將一個金屬盤置于干冰上作為冷凍的表面,以對片狀的組織進(jìn)行快速的冷凍。

 

下面三種力法分別描述用三種不同的方式加工 0.lg 冷凍的小鼠肝臟組織,以產(chǎn)生組織/細(xì)胞裂解產(chǎn)物。裂解產(chǎn)物可進(jìn)行 RNA 的提取純化,或用于估計 pdy(A)+RNA 的產(chǎn)量。雖然這三種方法同是利用胍緩沖液以*裂解細(xì)胞,但是它們在先前的步驟中,即如何加工組織或是在如何裂解的過程中有所不同。

實驗步驟:


方法一: 在勻漿器中加工冷凍的組織

產(chǎn)量:4.1ugpoly(A)ˉRNA

冷凍的組織在干冰上被切成大約 Cl5 cm2 的小片,轉(zhuǎn)人勻漿器中,一邊緩緩加入裂解緩沖液一邊不斷的勻漿。

 

方法二:通過注射器加工冷凍的組織。

產(chǎn)量:3.2ugpoly(A)-RNA。

冷凍的組織在干冰被切成大約 0.5 cm2 的小片,一邊緩緩加人裂解緩沖液一邊通過 18 號的標(biāo)準(zhǔn)注射針頭反復(fù)抽打十次。

 

方法三:在液氮中將組織研磨成粉末。

產(chǎn)量:7.1ugpoly(A)ˉRNA。

將冷凍的樣品放在研缽中進(jìn)行劇烈研磨以使其粉碎。當(dāng)組織被磨成粉狀后,向研缽中加人變忭緩沖液,并攪拌均勻。混合物融化后應(yīng)轉(zhuǎn)移到合適的容器中進(jìn)行進(jìn)一步的操作。在液氮中研磨組織至粉末狀,細(xì)胞的裂解則更*,因此能得到比前兩種方法多近一倍的產(chǎn)量。

 

可見,即使對于 N—種組織,采用同一種試劑進(jìn)行 RNA 的提取,僅僅由于組織樣品處理方法的不同,就導(dǎo)致了 RNA 提取量的顯著差異。因此,在對不同的組織進(jìn)行 RNA 提取時,不僅要選擇合適的提取方法,同時也要根據(jù)所處理的組織,以及提取目的以選擇為合適的組織處理方法,只有這樣才能獲得效果。

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