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上海古朵生物科技有限公司

生物技術(shù)常用實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)單介紹

時(shí)間:2021-11-1閱讀:247
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  一、總RNA的提取(Trizol法提取)
  在收集到生物材料之后,最好能即刻進(jìn)行RNA制備工作。若需暫時(shí)儲(chǔ)存,則應(yīng)以液氮將生物材料急速冷凍后,儲(chǔ)存于-80℃冷凍柜。在制備RNA時(shí),將儲(chǔ)存于冷凍柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破細(xì)胞,不可以先行解凍,以避免RNase的作用。

  1.  提取組織RNA時(shí),每50~100mg組織用1ml Trizol試劑對(duì)組織進(jìn)行裂解;提取細(xì)胞RNA時(shí),先離心沉淀細(xì)胞,每5-10 ╳106個(gè)細(xì)胞加1ml Trizol后,反復(fù)用槍吹打或劇烈振蕩以裂解細(xì)胞;
  2.  將上述組織或細(xì)胞的Trizol裂解液轉(zhuǎn)入EP管中,在室溫15~30C下放置5分鐘;
  3.  在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿,蓋上EP管蓋子,在手中用力震蕩15秒,在室溫下(15℃~30℃)放置2~3分鐘后,12000g(2℃~8℃)離心15分鐘;
  4.  取上層水相置于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml異丙醇的量加入異丙醇,在室溫下(15℃~30℃)放置10分鐘,12000g(2℃~8℃)離心10分鐘;
  5.  棄上清,按照每1ml TRIZOL加1ml 75%乙醇進(jìn)行洗滌,渦旋混合,7500g(2℃~8℃)離心5分鐘,棄上清;
  6.  讓沉淀的RNA在室溫下自然干燥;
  7.  用Rnase-free water 溶解RNA沉淀。

  二、瓊脂糖核酸電泳
  1.  用蒸餾水將制膠模具和梳子沖洗干凈,放在制膠平板上,封閉模具邊緣,架好梳子;
  2.  根據(jù)欲分離DNA 片段大小用凝膠緩沖液配制適宜濃度的瓊脂糖凝膠:準(zhǔn)確稱(chēng)量瓊脂糖干粉,加入到配膠用的三角燒瓶?jī)?nèi),定量加入電泳緩沖液(一般20~30 ml);
  3.  放入到微波爐內(nèi)加熱熔化。冷卻片刻,加入一滴熒光染料,輕輕旋轉(zhuǎn)以充分混勻凝膠溶液,倒入電泳槽中,待其凝固;
  4.  室溫下30~45分鐘后凝膠*凝結(jié),小心拔出梳子,將凝膠安放在電泳槽內(nèi);
  5.  向電泳槽中倒入電泳緩沖液,其量以沒(méi)過(guò)膠面1mm為宜,如樣品孔內(nèi)有氣泡,應(yīng)設(shè)法除去;
  6.  在DNA樣品中加入10×體積的載樣緩沖液(loading buffer),混勻后,用槍將樣品混合液緩慢加入被浸沒(méi)的凝膠加樣孔內(nèi);
  7.  接通電源,紅色為正極,黑色為負(fù)極,切記DNA樣品由負(fù)極往正極泳動(dòng) (靠近加樣孔的一端為負(fù))。一般60~100V電壓,電泳20~40min即可;
  8.  根據(jù)指示劑泳動(dòng)的位置,判斷是否終止電泳;
  9.  電泳完畢,關(guān)上電源,在凝膠成像儀上觀察電泳帶及其位置,并與核酸分子量標(biāo)準(zhǔn)Marker比較被擴(kuò)增產(chǎn)物的大小。

  瓊脂糖凝膠濃度  線形DNA的最佳分辨范圍(bp)
  0.5%   1,000~30,000
  0.7%   800~12,000
  1.0%   500~10,000
  1.2%   400~7,000
  1.5%   200~3,000
  2.0%   50~2,000

  三、膠回收純化DNA
  1.  瓊脂糖電泳,將特異電泳帶用刀切下放入到EP管中,稱(chēng)瓊脂糖帶的重量;
  2.  按照每100mg加400μl的量加入binding buffer,放入到EP管振蕩器中,45℃~55℃溫育振蕩,直到所有的瓊脂糖都溶解(大概要5分鐘);
  3.  取出純化柱,將上述溶解液轉(zhuǎn)移至柱中,室溫下放置2分鐘,8,000rpm 離心1分鐘,棄EP管中的液體,將純化柱放回EP管中;
  4.  加500μl的wash buffer至柱中,8,000rpm 離心1分鐘。棄管中的溶液;
  5.  重復(fù)操作4步的操作1次,最后將純化柱放入EP管中10,000rpm離心30秒,除去痕量的wash buffer;
  6.  將純化柱放入一個(gè)新的EP管。加30~40μl H2O或者elution buffer至純化柱膜的中央,在37℃或50℃下放置2分鐘,10,000rpm離心1分鐘洗脫DNA,將EP管中的DNA溶液放在-20℃保存。
  7.  注:若想要不電泳而直接純化DNA溶液,只需要在第2步中按100μl液量加400μl的binding buffer,其余的步驟不變。

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