DNA甲基化對于理解復(fù)雜性狀很有幫助，而二型糖尿病（T2D）就是一種相當(dāng)復(fù)雜的性狀。這種疾病有許多致病因素，遺傳易感性和環(huán)境條件都能顯著影響個(gè)體的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。
通過高通量的全基因組甲基化DNA免疫共沉淀測序MeDIP-seq，獲得了27對同卵雙胞胎的全血DNA甲基化圖譜。
血液中胰島素的或相對不足會引發(fā)糖尿病，這種疾病在當(dāng)今社會越來越常見。隨著人們生活水平的提高，糖尿病的發(fā)病率還在不斷攀升。理論上，這樣的干細(xì)胞能夠在隨后被操控生成可移植到病人體內(nèi)的各種細(xì)胞。如心臟細(xì)胞、肺細(xì)胞、肝細(xì)胞等。
MeDIP-seq是一種低成本的全基因組DNA甲基化組分析方法。研究人員對測序結(jié)果進(jìn)行了綜合性的“組學(xué)”分析，鑒定了與T2D有關(guān)的甲基化差異區(qū)域（DMR）。
研究顯示，MALT1基因的啟動子存在很顯著的差異性甲基化，這個(gè)基因涉及了胰島素和血糖通路，并且與血液中的牛磺膽酸鈉水平有關(guān)。研究人員將甲基化數(shù)據(jù)與T2D GWAS meta分析結(jié)合起來，發(fā)現(xiàn)DMR集中在T2D的易感位點(diǎn)。這項(xiàng)研究的同卵雙胞胎，有些是雙雙罹患T2D，有些只有一人患病。研究人員發(fā)現(xiàn)，GPR61和?PRKCB基因的差異性甲基化，只存在于患病情況不同的雙胞胎中。進(jìn)一步研究說明，這兩個(gè)基因很可能與疾病有因果和先后關(guān)系。
這項(xiàng)研究告訴我們，將基因組和表觀基因組結(jié)合起來對同卵雙胞胎進(jìn)行研究，能夠獲得重要的疾病線索，為人們提供T2D等復(fù)雜疾病的新藥物靶標(biāo)和生物學(xué)指標(biāo)。
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