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逆轉錄-聚合酶鏈反應 (RT-PCR) 實驗方法原理

時間:2024/5/6閱讀:208
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逆轉錄-聚合酶鏈反應 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR) 的原理是:提取組織或細胞中的總 RNA,以其中的 mRNA 作為模板,采用 Oligo(dT)或隨機引物利用逆轉錄酶反轉錄成 cDNA。再以 cDNA 為模板進行 PCR 擴增,而獲得目的基因或檢測基因表達。

實驗步驟:

一、總 RNA 的提取

按照總 RNA 提取實驗步驟提取組織或細胞中的總 RNA。


二、cDNA 第一鏈的合成

目前試劑公司有多種 cDNA 第一鏈試劑盒出售,其原理基本相同,但操作步驟不一。現以 GIBICOL 公司提供的 SuperScriptTM Preamplification System  for First Strand cDNA Synthesis 試劑盒為例。


在 0.5 ml 微量離心管中,加入總 RNA 1~5 μg,補充適量的 DEPC H2O 使總體積達 11 μl。在管中加 10 μM Oligo(dT)12~18 1 μl,輕輕混勻、離心;


70℃ 加熱 10 min,立即將微量離心管插入冰浴中至少 1 min;


取 0.5 ml PCR 管,依次加入下列試劑:第一鏈 cDNA   2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl。輕輕混勻,離心。42℃ 孵育 2~5 min;


加入 SuperscriptⅡ1 μl ,在 42℃ 水浴中孵育 50 min;


于 70℃ 加熱 15 min 以終止反應;


將管插入冰中,加入 RNase H 1 μl,37 ℃ 孵育 20 min,降解殘留的 RNA。-20 ℃ 保存備用。


三、PCR

取 0.5 ml PCR 管,依次加入下列試劑:第一鏈 cDNA   2 μl;上游引物(10 pM)2 μl;下游引物(10 pM)2 μl;dNTP(2 mM) 4 μl;10×PCR buffer 5 μl;Taq 酶(2 u/μl)1 μl;


加入適量的 ddH2O,使總體積達 50 μl。輕輕混勻,離心;


設定 PCR 程序。在適當的溫度參數下擴增 28~32 個循環。為了保證實驗結果的可靠與準確,可在 PCR 擴增目的基因時,加入一對內參(如 G3PD)的特異性引物,同時擴增內參 DNA,作為對照;


電泳鑒定:行瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下觀察結果;


密度掃描、結果分析:采用凝膠圖像分析系統,對電泳條帶進行密度掃描。




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