色譜分析是化工分析的重要手段，但是由于人員素質、樣品的性質以及儀器本身等方面的原因，會影響正常的生產分析，工作中必須注意氣相色譜儀的日常維護。
1、氣路系統
氣路必須保持良好的封閉性和管路內清潔：定期清洗。
注意：將氣路連接的金屬管接頭拆下，將各管線小心取出，擦拭外壁灰塵后再用無水乙醇清洗內壁。
考慮樣品分析過程中是否有其他不溶于乙醇的污染物：如有，可針對其溶解特性按照高沸點溶液優先原則選用合適溶液清潔。
閥的維護：氣相色譜儀不使用時，應對穩壓閥手柄進行放松調節，將針形閥撥到“開”的狀態。
氣路通氣時：先將穩流閥閥針打開，從大流量開始調向所需流量。
使用轉子流量計時保持氣源清潔：皂膜流量計使用時要保持濕潤、清潔狀態。
2、進樣系統
對進樣口要用丙酮和蒸餾水定時清理，避免硅橡膠等微粒堵塞進樣口。
定時更換玻璃襯管和進樣墊，未用注射器進樣時，不要推動柱塞，使用注射器前要用丙酮進行清洗，每次使用后也需要立即清洗。
3、分離系統
色譜柱是分離系統的核心部分，需要日常的維護和清理。新買的色譜柱在使用前要檢測其性能，裝上后要進行老化。使用完畢后要等柱溫下降到50度以下再關機。
如果色譜柱暫不使用，要將其從色譜儀上卸下，填充柱兩端用不銹鋼螺帽套上，毛細柱兩端用硅膠墊扎一個小孔后套上，妥善封存于柱包裝盒內避免污染。
4、檢測系統
噪聲和鬼峰一般都是檢測器上有污垢附著引起，對檢測器的維護主要是清洗，但要根據說明書或在專業人員的指導下進行適當的清洗維護。
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