研究人員從病人體內和一些醫院設備上取下了細菌樣本，分析了不同菌株的基因組，并找到了細菌擴散的途徑。原來細菌已經污染了很多醫院的器械。這項研究發表于8月22日的《科學•轉化醫學》（Science Translational Medicine）上，成為了疾病暴發后全基因組測序在醫院中的類似的應用。

這篇論文的通訊作者，國立人類基因組研究所（National Human Genome Research Institute）的朱莉•賽格雷（Julie Segre）表示，讓基因測序成為可能的原因是，現在它的價格已經很便宜，速度也快到了幾乎可以實時出結果的程度。去年，做一次基因組測序需要大約2000美元，從那時到現在，價格又降低了500美元。

研究結果顯示，細菌的源頭來自一位病人，而且擴散的途徑和預期并不相同，現有的防止院內感染的手段也不夠充分。傳染病學家曾經以為，疾病是從一個出現了血液感染跡象的病人直接傳染到第二個病人身上，但是細菌卻選擇了一種遠更復雜的途徑來傳播。*個病人來自紐約，43歲。根據分析的結果，他把細菌獨立地傳播給了病人3、病人4和病人8，這三人的于1個月之后發病。病人8并沒有進一步擴散疾病，但是病人3身上的菌株在病人5和病人2身上也被發現了。病人4把疾病傳播給了剩下所有的人。

研究人員相信細菌是通過醫院工作人員的雙手傳播的。此外，他們還在一位病人的呼吸機上發現了細菌，這說明目前常用的消毒機制并不足以讓機器擺脫細菌。塔拉•帕爾莫爾（Tara Palmore）是一位傳染病醫生，也是醫療中心的醫院傳染病學家代表和論文的作者。他說，盡管在這一案例中細菌并沒有通過呼吸機傳播，但是在其他地方也許會借助這一途徑擴散。

喬治•溫斯托克（George Weinstock）是圣路易斯華盛頓大學基因組研究所的副主任，也是那里的遺傳學和微生物學教授。他說，全基因組測序提供的詳盡細節讓傳染病學家們*次真正地理解了疾病傳播途徑。而詳盡的追蹤技術所帶來的教訓“將帶來更加精密的公共健康領域內的傳染病學研究。所以我們更有可能找到發生事件的真正原因，而非zui簡單的原因。”

去年六月到十二月間，美國國立衛生研究院位于馬里蘭州貝塞斯達（Bethesda）市的醫療中心共有17名病人感染了血液傳染病，6人因此死亡。醫生們知道，有個病人在6月帶著克雷伯氏肺炎菌（Klebsiella pneumoniae ）來到了醫院。但是這種常見的院內感染病的原兇是如何傳染開的？或者幾個不同的病人把它們帶到醫院里？這些問題還沒有答案。

這次疾病暴發讓改進感染控制手段的需求變得更加緊迫了。賽格雷說：“我們可以利用的抗生素已經很少了。而解決問題的*辦法是更好的感染控制手段。讓美國人保持健康的方法是讓他們不要生病。”